O exame Anatomopatológico envolve o processamento da amostra enviada, tornando-a adequada para confecção de blocos de parafina, a partir dos quais finas fatias de amostra (secções micrométricas) serão obtidas, coradas e preparadas para análise microscópica.
A obtenção do espécime se faz por cirurgia clássica, laparoscópica, endoscopia ou por agulhas especiais. Podem ser pequenas amostras teciduais (biópsias) ou de órgãos inteiros ou parciais (peça cirúrgica). A microscopia procura avaliar alterações na morfologia do tecido e células que compõem a amostra que, aliadas às informações clínico-laboratoriais resultam em um diagnóstico preciso que irá nortear a conduta cirúrgica e clínica.
Eventualmente, utilizam-se métodos complementares que possam contribuir para a elucidação diagnóstica (ex: técnicas de Coloração Especial, estudo Imuno-histoquímicos, entre outros).
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